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バイオインフォマティクス分野での並列アルゴリズム・大規模計算・情報抽出をテーマに研究を行っています.

所属・肩書き: 東京大学 医科学研究所 ヒトゲノム解析センター DNA 情報解析分野 特任講師

研究


DNA チップ等による遺伝子発現データ,タンパク間相互作用情報や DNA 配列情報などの生物学的なデータから,数学的・統計学的・情報科学的な方法によりスーパーコンピュータ(スパコン)を用いて,細胞内の遺伝子制御のネットワークである「遺伝子ネットワーク (Gene Network) 」を解き明かす研究をしています.

ソフトウェア・ウェブサービス


TCNG : 癌関連公開遺伝子発現データによる遺伝子ネットワークデータベース

SiGN-BN : ベイジアンネットワークを用いた遺伝子ネットワーク推定ソフトウェア

SiGN-SSM:状態空間モデルを用いた遺伝子ネットワーク推定ソフトウェア

Genomon : DNA シークエンス・マッピング&データ解析パイプライン

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連絡先


E-Mail アドレス: tamadaxatxims.u-tokyoxdotxacxdotxjpx (replace "at" with "@", "dot" with ".")
〒108-8639 東京都港区白金台 4-6-1 東京大学 医科学研究所 ヒトゲノム解析センター DNA 情報解析分野

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プロフィール


名前玉田 嘉紀(たまだ よしのり)
所属 東京大学 医科学研究所 ヒトゲノム解析センター DNA 情報解析分野
身分特任講師
学位 京都大学博士(情報学)(2005 年 11 月 24 日)
研究テーマ 生物情報学(バイオインフォマティクス,Bioinformatics)
システム生物学 (Systems Biology)
生物情報からの遺伝子ネットワーク推定
スーパーコンピュータによる超並列計算・大規模計算
知識発見支援システムの研究開発

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職歴


2005 年12 月 2006 年6 月 大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構 統計数理研究所 統計科学技術センター 助手(翌年 4 月より助教)
2006 年4 月 2006 年6 月 国立大学法人 総合研究大学院大学 複合科学研究科 統計科学専攻 助教(併任)
2006 年7 月 2008 年4 月 GNI Systems Pharmacology Research Institute Senior Researcher
2006 年 12 月 〜 2007 年 12 月 英国ケンブリッジ大学 Visiting Researcher
2008 年5 月 2011 年3 月 東京大学 医科学研究所 ヒトゲノム解析センター DNA 情報解析分野 特任助教
2011 年4 月 2016 年3 月 東京大学 大学院 情報理工学系研究科 コンピュータ科学専攻須田研究室) 助教(学部兼担:理学部 生物情報科学科
2016 年4 月 現職

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学歴


2001 年3 月 東海大学 理学部 情報数理学科 卒業
2003 年3 月 東海大学 大学院 理学研究科 数学専攻 修士課程(博士前期課程)修了
2005 年11 月 京都大学 大学院 情報学研究科 知能情報学専攻 博士後期課程修了
京都大学 化学研究所 バイオインフォマティクスセンター 生物情報ネットワーク研究領域(阿久津研究室)
学位:京都大学博士(情報学)取得

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リンク


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