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   玉田嘉紀のウェブサイトにようこそ

生命科学・医療分野での AI(人工知能)・機械学習・並列アルゴリズム・大規模計算・情報抽出・知識発見をテーマに研究を行っています。

所属・肩書き: 京都大学 大学院 医学研究科 人間健康科学系専攻 医療情報AIシステム学講座(奥野研) 特定准教授

  

近著


確率的グラフィカルモデル 鈴木 譲・植野 真臣編著 共立出版

研究


医療情報AIシステム学

電子カルテに蓄積された患者データなどの各種医療情報、生命科学・医学分野における過去の膨大な文献情報、各種バイオインフォマティクス手法、数学的・統計学的・情報科学的モデリング手法、機械学習、人工知能 (AI) を組み合わせ、診療支援・創薬・医療高度化・個別化医療の実現を目指します。

遺伝子ネットワーク推定・解析

DNA チップ等による遺伝子発現データ、タンパク間相互作用情報や DNA 配列情報などの生物学的なデータから、数学的・統計学的・情報科学的な方法によりスーパーコンピュータ(スパコン)を用いて,細胞内の遺伝子制御のネットワークである「遺伝子ネットワーク (Gene Network) 」を解き明かす研究をしています。

連絡先


E-Mail アドレス: tamadaxdotxyoshinorixdotx8axatxkyoto-uxdotxacxdotxjpx (replace "at" with "@", "dot" with ".")
〒606-8507 京都市左京区聖護院川原町54 先端医療機器開発・臨床研究センター106号室

ソフトウェア・ウェブサービス


TCNG : 癌関連公開遺伝子発現データによる遺伝子ネットワークデータベース

SiGN : 遺伝子ネットワーク推定ソフトウェア群

   バックアップサイト HGC のウェブサーバーがメンテナンスなどで繋がらない場合はここを参照ください。

SiGN-BN : ベイジアンネットワークを用いた遺伝子ネットワーク推定ソフトウェア

SiGN-SSM:状態空間モデルを用いた遺伝子ネットワーク推定ソフトウェア

Genomon : DNA シークエンス・マッピング&データ解析パイプライン

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プロフィール


名前玉田 嘉紀(たまだ よしのり)
所属 京都大学 大学院 医学研究科 人間健康科学系専攻 医療情報AIシステム学講座(共同研究講座)
職位特定准教授
学位 京都大学博士(情報学)(2005 年 11 月 24 日)
研究テーマ 生物情報学(バイオインフォマティクス,Bioinformatics)
システム生物学 (Systems Biology)
生物情報からの遺伝子ネットワーク推定
スーパーコンピュータによる超並列計算・大規模計算
知識発見支援システムの研究開発

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職歴


2005 年12 月 2006 年6 月 大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構 統計数理研究所 統計科学技術センター 助手
2006 年4 月 2006 年6 月 国立大学法人 総合研究大学院大学 複合科学研究科 統計科学専攻 助手(併任)
2006 年7 月 2008 年4 月 GNI Systems Pharmacology Research Institute Senior Researcher
2006 年 12 月 〜 2007 年 12 月 英国ケンブリッジ大学 Visiting Researcher
2008 年5 月 2011 年3 月 東京大学 医科学研究所 ヒトゲノム解析センター DNA 情報解析分野 特任助教
2011 年4 月 2016 年3 月 東京大学 大学院 情報理工学系研究科 コンピュータ科学専攻須田研究室) 助教(学部兼担:理学部 生物情報科学科
2016 年4 月 2017 年12 月 東京大学 医科学研究所 ヒトゲノム解析センター DNA 情報解析分野 特任講師
2018 年1 月 現職

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学歴


2001 年3 月 東海大学 理学部 情報数理学科 卒業
2003 年3 月 東海大学 大学院 理学研究科 数学専攻 修士課程(博士前期課程)修了
2005 年11 月 京都大学 大学院 情報学研究科 知能情報学専攻 博士後期課程修了
京都大学 化学研究所 バイオインフォマティクスセンター 生物情報ネットワーク研究領域(阿久津研究室)
学位:京都大学博士(情報学)取得

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リンク


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