Home  : :  Publications  : :  Web Supplement  : :  Old Info English

   玉田嘉紀のウェブサイトにようこそ

医療・生命科学分野でのデータ解析・AI(人工知能)・機械学習・並列アルゴリズム・大規模計算・情報抽出・知識発見をテーマに研究・教育を行っています。

所属・肩書き: 弘前大学 健康未来イノベーションセンター (大学院医学研究科附属) データ解析部門長/医療データ解析学講座・教授
京都大学 大学院医学研究科 ビッグデータ医科学分野 客員研究員
居室: 本町地区・社会医学棟(附属脳神経血管病態研究施設)(本町地区キャンパスマップの⑥)1階 健康未来イノベーションセンター 教授室
オフィスアワー: 要事前予約(必ずメールでアポイントを取ってください)

医療データ解析学講座の臨時Webページはこちら

弘前大学COIのwebページはこちら

  

近著


確率的グラフィカルモデル 鈴木 譲・植野 真臣編著 共立出版

連絡先


E-Mail アドレス: y.tamadaxatxhirosaki-uxdotxacxdotxjpx (replace "xatx" with "@", "xdotx" with ".")
〒036-8562 青森県弘前市在府町5 弘前大学 健康未来イノベーションセンター
PGP Public Key (fingerprint: 308D 0D57 7755 33F8 FAAA 7006 E5FD A985 2BDF 40D8)

研究


医療データ解析学

弘前大学 COI に代表される検診ビッグデータ、電子カルテに蓄積された患者データなどの各種医療情報、生命科学・医学分野における過去の膨大な文献情報、各種バイオインフォマティクス手法、数学的・統計学的・情報科学的モデリング手法、機械学習、人工知能 (AI) を組み合わせ、診療支援・創薬・医療高度化・個別化医療の実現を目指します。

遺伝子ネットワーク推定・解析

RNA-Seq 等による遺伝子発現データ、タンパク間相互作用情報や DNA 配列情報などの生物学的なデータから、数学的・統計学的・情報科学的な方法によりスーパーコンピュータ(スパコン)を用いて,細胞内の遺伝子制御のネットワークである「遺伝子ネットワーク (Gene Network) 」を解き明かす研究をしています。

令和 3 年度(西暦 2021 年度)外部資金・研究プロジェクト

担当授業


2021年度(令和3年度)の担当授業については所属講座のページを見てください。

過去の担当授業

ソフトウェア・ウェブサービス


TCNG : 癌関連公開遺伝子発現データによる遺伝子ネットワークデータベース

SiGN : 遺伝子ネットワーク推定ソフトウェア群

   バックアップサイト HGC のウェブサーバーがメンテナンスなどで繋がらない場合はここを参照ください。

SiGN-BN : ベイジアンネットワークを用いた遺伝子ネットワーク推定ソフトウェア

SiGN-SSM:状態空間モデルを用いた遺伝子ネットワーク推定ソフトウェア

Genomon : DNA シークエンス・マッピング&データ解析パイプライン

▲ Top

プロフィール


名前玉田 嘉紀(たまだ よしのり)
所属 弘前大学 健康未来イノベーションセンター(大学院医学研究科附属)医療データ解析学講座
職位教授
その他の
所属・身分
京都大学 大学院 医学研究科 ビッグデータ医科学分野 客員研究員
学位 京都大学博士(情報学)(2005 年 11 月 24 日)
研究テーマ 医療データ解析学
ビッグデータ医科学
生物情報学(バイオインフォマティクス,Bioinformatics)
システム生物学 (Systems Biology)
生物情報からの遺伝子ネットワーク推定
スーパーコンピュータによる超並列計算・大規模計算
知識発見支援システムの研究開発
その他の所属 下記、医学研究科共同研究講座の教授も併任しています。
・アクティブライフポロモーション学研究講座
・先制栄養医学講座
・ウォーターヘルスサイエンス講座
・野菜生命科学講座
・フローラ健康科学講座
・QOL推進医学講座
・食と健康 科学講座
・健康と美 医科学講座
・未病科学研究講座
・オーラルヘルスケア学講座
・フレイル予防学研究講座
・メタボロミクスイノベーション学講座
・デジタルニュートリション学講座
・プレシジョンヘルスケア学講座

▲ Top

職歴


2005 年12 月 2006 年6 月 大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構 統計数理研究所 統計科学技術センター 助手
2006 年4 月 2006 年6 月 国立大学法人 総合研究大学院大学 複合科学研究科 統計科学専攻 助手(併任)
2006 年7 月 2008 年4 月 GNI Systems Pharmacology Research Institute Senior Researcher
2006 年 12 月 〜 2007 年 12 月 英国ケンブリッジ大学 Visiting Researcher
2008 年5 月 2011 年3 月 東京大学 医科学研究所 ヒトゲノム解析センター DNA 情報解析分野 特任助教
2011 年4 月 2016 年3 月 東京大学 大学院 情報理工学系研究科 コンピュータ科学専攻須田研究室) 助教(学部兼担:理学部 生物情報科学科
2016 年4 月 2017 年12 月 東京大学 医科学研究所 ヒトゲノム解析センター DNA 情報解析分野 特任講師
2018 年1 月 2020 年3 月 京都大学 大学院 医学研究科 人間健康科学系専攻 医療情報AIシステム学講座(富士通株式会社・株式会社富士通研究所との共同研究講座。2020年3月末日で終了) 特定准教授
2020 年4 月 2020 年10 月 京都大学 大学院 医学研究科 人間健康科学系専攻 臨床看護学講座 ビッグデータ医科学分野(奥野研) 特定准教授
2020 年4 月 2020 年10 月 理化学研究所 科技ハブ産連本部 医科学イノベーションハブ推進プログラム 医薬プロセス最適化プラットフォーム推進グループ 客員研究員
2020 年11 月 現職
2021 年4 月 京都大学 大学院 医学研究科 ビッグデータ医科学分野 客員研究員

▲ Top

学歴


2001 年3 月 東海大学 理学部 情報数理学科 卒業
2003 年3 月 東海大学 大学院 理学研究科 数学専攻 修士課程(博士前期課程)修了
2005 年11 月 京都大学 大学院 情報学研究科 知能情報学専攻 博士後期課程修了
京都大学 化学研究所 バイオインフォマティクスセンター 生物情報ネットワーク研究領域(阿久津研究室)
学位:京都大学博士(情報学)取得

▲ Top

リンク


▲ Top

Copyright 制作・著作 © 2012-2020 玉田嘉紀