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   玉田嘉紀のウェブサイトにようこそ

医療・生命科学分野でのビッグデータ解析・AI(人工知能)・機械学習・並列アルゴリズム・大規模計算・情報抽出・知識発見をテーマに研究・教育を行っています。

弘前大学医学部バスケットボールサークルやってます。🏀 興味のある方はお気軽に連絡ください。

所属・肩書き: 弘前大学 健康未来イノベーションセンター ( 大学院医学研究科 附属) データ解析部門長/ 医療データ解析学講座 ・教授
弘前大学 数理・データサイエンス教育センター 副センター長
一般社団法人ライフ インテリジェンス コンソーシアム (LINC) WG02 共同代表
京都大学 大学院医学研究科 ビッグデータ医科学分野 客員研究員
居室: 本町地区・社会医学棟(附属脳神経血管病態研究施設)( 本町地区キャンパスマップ の⑥)1階 健康未来イノベーションセンター 教授室
オフィスアワー: 要事前予約(必ずメールでアポイントを取ってください)

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近著


確率的グラフィカルモデル 鈴木 譲・植野 真臣編著 共立出版

連絡先


E-Mail アドレス: y.tamada x at x hirosaki-u x dot x ac x dot x jp x (replace " x at x " with " @ ", " x dot x " with " . ")
〒036-8562 青森県弘前市在府町5 弘前大学 健康未来イノベーションセンター
PGP Public Key (fingerprint: 308D 0D57 7755 33F8 FAAA 7006 E5FD A985 2BDF 40D8)

研究


医療データ解析学

弘前大学 COI に代表される検診ビッグデータ、電子カルテに蓄積された患者データなどの各種医療情報、生命科学・医学分野における過去の膨大な文献情報、各種バイオインフォマティクス手法、数学的・統計学的・情報科学的モデリング手法、機械学習、人工知能 (AI) を組み合わせ、診療支援・創薬・医療高度化・個別化医療の実現を目指します。

遺伝子ネットワーク推定・解析

RNA-Seq 等による遺伝子発現データ、タンパク間相互作用情報や DNA 配列情報などの生物学的なデータから、数学的・統計学的・情報科学的な方法によりスーパーコンピュータ(スパコン)を用いて,細胞内の遺伝子制御のネットワークである「遺伝子ネットワーク (Gene Network) 」を解き明かす研究をしています。

令和 4 年度(西暦 2022 年度)外部資金・研究プロジェクト

担当授業


2022年度(令和4年度)の担当授業については 所属講座のページ を見てください。

過去の担当授業

ソフトウェア・ウェブサービス


TCNG : 癌関連公開遺伝子発現データによる遺伝子ネットワークデータベース

SiGN : 遺伝子ネットワーク推定ソフトウェア群

    バックアップサイト  HGC のウェブサーバーがメンテナンスなどで繋がらない場合はここを参照ください。

SiGN-BN : ベイジアンネットワークを用いた遺伝子ネットワーク推定ソフトウェア

SiGN-SSM :状態空間モデルを用いた遺伝子ネットワーク推定ソフトウェア

Genomon : DNA シークエンス・マッピング&データ解析パイプライン

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プロフィール


名前 玉田 嘉紀(たまだ よしのり)
所属 弘前大学 健康未来イノベーションセンター( 大学院医学研究科 附属)医療データ解析学講座
職位 教授
その他の
所属・身分
京都大学 大学院 医学研究科 ビッグデータ医科学分野 客員研究員
学位 京都大学博士(情報学)(2005 年 11 月 24 日)
研究テーマ 医療データ解析学
ビッグデータ医科学
医療ビッグデータ解析
生物情報学(バイオインフォマティクス,Bioinformatics)
システム生物学 (Systems Biology)
遺伝子ネットワーク推定
超多変量ベイジアンネットワーク推定
スーパーコンピュータによる超並列計算・大規模計算
知識発見支援システムの研究開発
その他の所属 下記、医学研究科共同研究講座の教授も併任しています。
(詳細は 研究科講座一覧 をご覧ください)
・健康寿命延伸学講座(令和4年8月1日〜)
・QOL推進医学講座(令和4年5月1日〜)
・メタボロミクスイノベーション学講座(令和4年5月1日〜)
・ビューティウェルネス学研究講座(令和4年4月1日〜)
・未病科学研究講座(令和3年4月1日〜)
・データヘルス研究講座(令和3年4月1日〜)
・プレシジョンヘルスケア学講座(令和3年4月1日〜)
・野菜生命科学講座(令和3年1月1日〜)
・アクティブライフポロモーション学研究講座(令和2年11月1日〜、以下同)
・食と健康 科学講座
・先制栄養医学講座
・フローラ健康科学講座
・デジタルニュートリション学講座

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職歴


2005 年 12 月 2006 年 6 月 大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構 統計数理研究所 統計科学技術センター 助手
2006 年 4 月 2006 年 6 月 国立大学法人 総合研究大学院大学 複合科学研究科 統計科学専攻 助手(併任)
2006 年 7 月 2008 年 4 月 GNI Systems Pharmacology Research Institute Senior Researcher
2006 年 12 月 〜 2007 年 12 月 英国ケンブリッジ大学 Visiting Researcher
2008 年 5 月 2011 年 3 月 東京大学 医科学研究所 ヒトゲノム解析センター DNA 情報解析分野 特任助教
2011 年 4 月 2016 年 3 月 東京大学 大学院 情報理工学系研究科 コンピュータ科学専攻須田研究室 ) 助教(学部兼担: 理学部 生物情報科学科
2016 年 4 月 2017 年 12 月 東京大学 医科学研究所 ヒトゲノム解析センター DNA 情報解析分野 特任講師
2018 年 1 月 2020 年 3 月 京都大学 大学院 医学研究科 人間健康科学系専攻 医療情報AIシステム学講座(富士通株式会社・株式会社富士通研究所との共同研究講座。2020年3月末日で終了) 特定准教授
2020 年 4 月 2020 年 10 月 京都大学 大学院 医学研究科 人間健康科学系専攻 臨床看護学講座 ビッグデータ医科学分野( 奥野研 ) 特定准教授
2020 年 4 月 2020 年 10 月 理化学研究所 科技ハブ産連本部 医科学イノベーションハブ推進プログラム 医薬プロセス最適化プラットフォーム推進グループ 客員研究員
2020 年 11 月 現職
2021 年 4 月 京都大学 大学院 医学研究科 ビッグデータ医科学分野 客員研究員

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学歴


2001 年 3 月 東海大学 理学部 情報数理学科 卒業
2003 年 3 月 東海大学 大学院 理学研究科 数学専攻 修士課程(博士前期課程)修了
2005 年 11 月 京都大学 大学院 情報学研究科 知能情報学専攻 博士後期課程修了
京都大学 化学研究所 バイオインフォマティクスセンター 生物情報ネットワーク研究領域(阿久津研究室)
学位:京都大学博士(情報学)取得

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リンク


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